Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp3a41aQ9JMA7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp3a41aQ9JMA7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a41aQ9JMA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp3a41aQ9JMA7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms