Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg4Q9JM99 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prg4Q9JM99 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prg4Q9JM99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prg4Q9JM99 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prg4Q9JM99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prg4Q9JM99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms