Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FancaQ9JL70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FancaQ9JL70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FancaQ9JL70 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FancaQ9JL70 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FancaQ9JL70 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FancaQ9JL70 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FancaQ9JL70 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FancaQ9JL70 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
FancaQ9JL70 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FancaQ9JL70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FancaQ9JL70 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FancaQ9JL70 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FancaQ9JL70 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FancaQ9JL70 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FancaQ9JL70 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
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