Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gde1Q9JL56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gde1Q9JL56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gde1Q9JL56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gde1Q9JL56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gde1Q9JL56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gde1Q9JL56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gde1Q9JL56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gde1Q9JL56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gde1Q9JL56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gde1Q9JL56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gde1Q9JL56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gde1Q9JL56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gde1Q9JL56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gde1Q9JL56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gde1Q9JL56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms