Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK38

Gnpnat1, Glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpnat1Q9JK38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnpnat1Q9JK38 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpnat1Q9JK38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gnpnat1Q9JK38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnpnat1Q9JK38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gnpnat1Q9JK38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gnpnat1Q9JK38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gnpnat1Q9JK38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gnpnat1Q9JK38 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gnpnat1Q9JK38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gnpnat1Q9JK38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms