Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnbip1Q9JJN6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbip1Q9JJN6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms