Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpn1Q9JJN5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cpn1Q9JJN5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpn1Q9JJN5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpn1Q9JJN5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpn1Q9JJN5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cpn1Q9JJN5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpn1Q9JJN5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms