Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJI8

Rpl38, 60S ribosomal protein L38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl38Q9JJI8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl38Q9JJI8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl38Q9JJI8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl38Q9JJI8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl38Q9JJI8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpl38Q9JJI8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms