Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc86Q9JJ89 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc86Q9JJ89 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc86Q9JJ89 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc86Q9JJ89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc86Q9JJ89 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc86Q9JJ89 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc86Q9JJ89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms