Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Copb1Q9JIF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Copb1Q9JIF7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Copb1Q9JIF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Copb1Q9JIF7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Copb1Q9JIF7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Copb1Q9JIF7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Copb1Q9JIF7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Copb1Q9JIF7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Copb1Q9JIF7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Copb1Q9JIF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Copb1Q9JIF7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Copb1Q9JIF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Copb1Q9JIF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms