Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn12Q9ET43 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn12Q9ET43 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn12Q9ET43 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn12Q9ET43 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn12Q9ET43 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn12Q9ET43 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms