Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET39

Slamf6, SLAM family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf6Q9ET39 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slamf6Q9ET39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slamf6Q9ET39 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slamf6Q9ET39 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slamf6Q9ET39 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms