Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim2Q9ESN6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim2Q9ESN6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim2Q9ESN6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim2Q9ESN6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim2Q9ESN6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms