Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Erg28Q9ERY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Erg28Q9ERY9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Erg28Q9ERY9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms