Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slco1c1Q9ERB5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slco1c1Q9ERB5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slco1c1Q9ERB5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slco1c1Q9ERB5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco1c1Q9ERB5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms