Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn12Q9ER56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn12Q9ER56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Capn12Q9ER56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn12Q9ER56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn12Q9ER56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms