Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Susd2Q9DBX3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd2Q9DBX3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd2Q9DBX3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd2Q9DBX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd2Q9DBX3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms