Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf6Q9DBU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf6Q9DBU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf6Q9DBU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf6Q9DBU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf6Q9DBU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf6Q9DBU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf6Q9DBU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms