Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp2aQ9DB34 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp2aQ9DB34 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2aQ9DB34 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp2aQ9DB34 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp2aQ9DB34 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms