Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U7

Dtwd1, DTW domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtwd1Q9D8U7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dtwd1Q9D8U7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dtwd1Q9D8U7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dtwd1Q9D8U7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dtwd1Q9D8U7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dtwd1Q9D8U7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dtwd1Q9D8U7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dtwd1Q9D8U7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dtwd1Q9D8U7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms