Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Slc52a2Q9D8F3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Slc52a2Q9D8F3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slc52a2Q9D8F3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Slc52a2Q9D8F3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Slc52a2Q9D8F3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Slc52a2Q9D8F3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slc52a2Q9D8F3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slc52a2Q9D8F3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Slc52a2Q9D8F3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Slc52a2Q9D8F3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Slc52a2Q9D8F3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slc52a2Q9D8F3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Slc52a2Q9D8F3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Slc52a2Q9D8F3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Slc52a2Q9D8F3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Slc52a2Q9D8F3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slc52a2Q9D8F3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms