Protein–RNA interactions for Protein: Q9D819

Ppa1, Inorganic pyrophosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppa1Q9D819 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppa1Q9D819 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppa1Q9D819 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppa1Q9D819 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppa1Q9D819 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppa1Q9D819 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppa1Q9D819 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppa1Q9D819 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppa1Q9D819 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppa1Q9D819 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppa1Q9D819 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppa1Q9D819 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppa1Q9D819 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms