Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn9Q9D805 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn9Q9D805 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn9Q9D805 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn9Q9D805 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn9Q9D805 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Capn9Q9D805 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn9Q9D805 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms