Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn22Q9D7U6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn22Q9D7U6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn22Q9D7U6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn22Q9D7U6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn22Q9D7U6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn22Q9D7U6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn22Q9D7U6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn22Q9D7U6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn22Q9D7U6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn22Q9D7U6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn22Q9D7U6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn22Q9D7U6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms