Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfsf13Q9D777 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf13Q9D777 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf13Q9D777 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfsf13Q9D777 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms