Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6U8

Fam162a, Protein FAM162A, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam162aQ9D6U8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam162aQ9D6U8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam162aQ9D6U8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam162aQ9D6U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam162aQ9D6U8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam162aQ9D6U8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms