Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc2Q9D6K8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc2Q9D6K8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fundc2Q9D6K8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fundc2Q9D6K8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms