Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hrct1Q9D6B9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hrct1Q9D6B9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hrct1Q9D6B9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hrct1Q9D6B9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms