Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gins2Q9D600 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gins2Q9D600 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gins2Q9D600 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gins2Q9D600 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gins2Q9D600 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gins2Q9D600 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gins2Q9D600 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gins2Q9D600 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gins2Q9D600 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gins2Q9D600 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms