Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D4W2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D4W2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D4W2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D4W2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D4W2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D4W2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D4W2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D4W2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D4W2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D4W2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D4W2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D4W2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D4W2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D4W2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D4W2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D4W2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D4W2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms