Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930556J24RikQ9D4U7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms