Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4M5

4931400O07Rik, MCG14882, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931400O07RikQ9D4M5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4931400O07RikQ9D4M5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4931400O07RikQ9D4M5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
4931400O07RikQ9D4M5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4931400O07RikQ9D4M5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
4931400O07RikQ9D4M5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4931400O07RikQ9D4M5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4931400O07RikQ9D4M5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4931400O07RikQ9D4M5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4931400O07RikQ9D4M5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4931400O07RikQ9D4M5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms