Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmntd1Q9D4C1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmntd1Q9D4C1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmntd1Q9D4C1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmntd1Q9D4C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmntd1Q9D4C1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmntd1Q9D4C1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms