Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tssk4Q9D411 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tssk4Q9D411 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tssk4Q9D411 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tssk4Q9D411 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tssk4Q9D411 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tssk4Q9D411 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tssk4Q9D411 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tssk4Q9D411 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tssk4Q9D411 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms