Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpn3Q9D3W4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpn3Q9D3W4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpn3Q9D3W4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpn3Q9D3W4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpn3Q9D3W4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpn3Q9D3W4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpn3Q9D3W4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpn3Q9D3W4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpn3Q9D3W4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpn3Q9D3W4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpn3Q9D3W4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms