Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx29Q9D3S3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx29Q9D3S3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx29Q9D3S3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snx29Q9D3S3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx29Q9D3S3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx29Q9D3S3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx29Q9D3S3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms