Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps33aQ9D2N9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps33aQ9D2N9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps33aQ9D2N9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps33aQ9D2N9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps33aQ9D2N9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms