Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc6bQ9D289 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc6bQ9D289 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc6bQ9D289 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc6bQ9D289 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc6bQ9D289 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms