Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krtap5-3Q9D226 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krtap5-3Q9D226 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krtap5-3Q9D226 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krtap5-3Q9D226 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krtap5-3Q9D226 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krtap5-3Q9D226 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms