Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MrnipQ9D1F5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MrnipQ9D1F5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MrnipQ9D1F5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MrnipQ9D1F5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MrnipQ9D1F5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MrnipQ9D1F5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MrnipQ9D1F5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MrnipQ9D1F5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms