Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cysrt1Q9D1E4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cysrt1Q9D1E4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cysrt1Q9D1E4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cysrt1Q9D1E4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cysrt1Q9D1E4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cysrt1Q9D1E4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cysrt1Q9D1E4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cysrt1Q9D1E4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cysrt1Q9D1E4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cysrt1Q9D1E4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cysrt1Q9D1E4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cysrt1Q9D1E4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cysrt1Q9D1E4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cysrt1Q9D1E4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms