Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arv1Q9D0U9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arv1Q9D0U9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arv1Q9D0U9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms