Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spc24Q9D083 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spc24Q9D083 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spc24Q9D083 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spc24Q9D083 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spc24Q9D083 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms