Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm1Q9D067 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdm1Q9D067 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdm1Q9D067 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdm1Q9D067 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm1Q9D067 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mdm1Q9D067 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mdm1Q9D067 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms