Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufsp1Q9CZP0 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufsp1Q9CZP0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp1Q9CZP0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms