Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mis12Q9CY25 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mis12Q9CY25 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mis12Q9CY25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mis12Q9CY25 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mis12Q9CY25 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mis12Q9CY25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mis12Q9CY25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mis12Q9CY25 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis12Q9CY25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis12Q9CY25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mis12Q9CY25 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms