Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bud23Q9CY21 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud23Q9CY21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud23Q9CY21 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bud23Q9CY21 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bud23Q9CY21 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bud23Q9CY21 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms