Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sgo1Q9CXH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sgo1Q9CXH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgo1Q9CXH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgo1Q9CXH7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgo1Q9CXH7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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