Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yif1bQ9CX30 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yif1bQ9CX30 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yif1bQ9CX30 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yif1bQ9CX30 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yif1bQ9CX30 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms