Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx10Q9CWT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx10Q9CWT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx10Q9CWT3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx10Q9CWT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx10Q9CWT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx10Q9CWT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx10Q9CWT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms